Nathan Never entra in possesso dell'unica copia rimasta del film "2001: Odissea nello spazio": la divulgazione della pellicola svelerebbe la truffa ordita da Marcus Hackman, fondatore della setta degli adoratori del Monolito Nero. Sulle tracce del film si mettono Ash e Leonid, malviventi al servizio di Hackman, che rapiscono Penelope Peabody, nipote delle vicine di Nathan, per costringere l'agente Alfa a consegnare loro il film. Ma anche i mutati, assoldati dal collezionista Al Castle, vogliono recuperare la pellicola...
Nathan Never viene incaricato dal governo di recuperare dei mortali batteri rubati da Athos Than, un criminale che governa un piccolo stato indipendente, Dragon Island. Than ha intenzione di creare, grazie ai batteri, una razza di super-uomini asserviti alla sua volontà. Nathan viene inviato sull'isola sotto l'identità di Robert Clouse, un campione di arti marziali, iscritto al torneo di jeet-kune-doo che vi si svolge ogni due anni...
Kal Skotos rapisce i passeggeri di uno shuttle, il dottor Alan Byrne e la giovane June, e li trasporta su Hell's Island, un'isola su cui è proibito l'accesso a causa di un pericoloso virus che ne ha contagiato gli abitanti, rendendoli dei mostri mutanti. Nathan Never viene incaricato di liberare i due prigionieri e di riportarli indietro entro quarantott'ore, prima di essere contagiato a sua volta. L'agente Alfa riesce a liberare Byrne e June, grazie all'allarme creato tra gli uomini di Skotos da un misterioso gruppo di uomini in armatura...
Nathan Never riesce a sfuggire agli uomini della Fratellanza Ombra, grazie all'aiuto di una comunità di "uomini-bambini" guidata da Bill e Sony. Ma per sfuggire agli sgherri di Skotos e ai misteriosi Uomini Ombra e portare in salvo Byrne e June (che inizia ad accusare un inspiegabile malore), Nathan deve affrontare il terribile Big Sam...
Chi ha ucciso Hannah Owens, una donna sola e introversa dalla vita apparentemente normale? È quello che l'unica amica della vittima, Lucy Vega, chiede a Nathan Never di scoprire. Durante le indagini, Nathan appura, con l'aiuto di Sigmund Baginov, che altre tre donne sole come la Owens sono state uccise in modo simile. Durante la perquisizione dell'appartamento di Hannah, Nathan viene stordito da un misterioso individuo. Nella fretta di fuggire, lo sconosciuto ha però perso una videocassetta...
Hans Schneider, un giovane che si batte per i diritti dei mutati, dopo un tentativo di rapina si rifugia nel primo livello. Nathan Never viene incaricato dai genitori di Hans di riportare a casa il ragazzo che, nel frattempo, ha trovato rifugio presso la chiesa di padre Omero. Ma l'agente Alfa, una volta disceso fino al fondo della Città, si troverà ad affrontare i mercenari del comandante Edwards, che danno la caccia ad Hans per aggiudicarsi la taglia che il politico Franz Hoenzoller ha messo sul ragazzo...
Nathan Never è incaricato di indagare sulla morte di un cadetto della Fanteria dello Spazio, di nome John Hartman. Nathan, sotto la falsa identità del tenente Noah Bright, entra nella Armstrong Academy come responsabile di un gruppo di cadetti. L'agente Alfa scopre ben presto che un secondo gruppo di cadetti, addestrato dal capitano Susan Connery, fa registrare nelle esercitazioni dei punteggi eccessivamente brillanti...
Durante un'esercitazione, il capitano Connery rischia di uccidere per errore un cadetto del gruppo di Nathan Never. L'agente Alfa scopre così che ai cadetti addestrati dalla Connery viene somministrato l'euridal policlorico, una droga potenziante con effetti mutageni, allo scopo di farli diventare invincibili e contrastare così i fanti spaziali addestrati sulle stazioni orbitanti. Quando si accorge che Nathan ha scoperto il suo piano, Susan Connery lo fa catturare e gli lancia un'ultima sfida...
Nathan Never viene incaricato da Cora, moglie del professor Alex Arnold, di indagare sulla morte misteriosa del marito. Arnold era stato, anni prima, responsabile scientifico di una missione su un asteroide durante la quale aveva reperito, e aperto, un involucro di probabile origine aliena. Nathan, con l'aiuto del pilota di shuttle Jerry Lone, si mette sulle tracce di Herbert Benson, l'ultimo ad aver incontrato Arnold. Ma la sorte del professore interessa anche ad Aristotele Skotos e alla Fratellanza Ombra...
Precipitato nel Territorio (una vasta area desertica in parte contaminata da letali radiazioni) con il suo flyer, Nathan Never viene soccorso dagli abitanti di una valle nascosta e accolto nella casa di Jake e Marian Heflin, e dal loro figlio Joey. La valle, chiamata Cielo Verde, si stende su un'area fertilissima con un sottosuolo ricco di petrolio, che fa gola al sinistro signor King...