Una frana, causata dalle forti piogge, riporta alla luce l'ingresso di una caverna che avrebbe dovuto rimanere celata per sempre, mentre una strana e minacciosa visione fa tornare a Zagor la memoria su eventi lontani che erano stati cancellati dalla sua mente. Lo Spirito con la Scure si trova improvvisamente coinvolto in una drammatica avventura, sospesa fra passato e presente, costretto ad affrontare una minaccia creduta sepolta e a prepararsi per nuovi, drammatici eventi che si annunciano per l'imminente futuro...
Una frana ha riportato alla luce un'enorme cavità sotterranea, dal cui fondo emergono creature mostruose. Zagor, accompagnato da Cico e da un gruppo di indiani, discende nell’abisso per scoprire che cosa vi si nasconda. Intanto, dal passato dello Spirito con la Scure, i frammenti di una memoria che gli era stata cancellata dalla sciamana Shyer tornano a galla, creando un inquietante collegamento con il presente: i ricordi che riaffiorano sembrano infatti legati proprio al segreto celato nella grande caverna...
Dopo essere sbarcato a Lima deciso a fermare l’archeologo Dexter Green, lo Spirito con la Scure si trova coinvolto in altre pericolose vicende intrecciate fra loro: il rapimento della bella Soledad, figlia della curandera Mama Jacinta, da parte di Barranco, un misterioso assassino, e le trame di don Cristobal Torres, proprietario di una manifattura in cui sfrutta senza scrupolo alcuno il lavoro degli indios. Tutte e tre le piste portano però nella medesima direzione: la città di Cuzco, alle falde della Cordigliera delle Ande...
Continua la caccia alle Amazzoni da parte del crudele Dorival, il quale ha una vendetta da compiere contro le donne guerriere che hanno ucciso, in passato, suo padre e suo fratello. Zagor, che si è alleato con Crystal, a capo della sorellanza, e Marie Laveau, che si è unita alle combattenti di origine atlantidea, cerca di portare in salvo Cico e il botanico Spruce, che è riuscito a liberare dalle grinfie di Barranco. Ma i mercenari bianchi sono numerosi, ben armati e spietati...
Zagor e Cico giungono al porto di Concepcion, in Cile. Durante tutto il viaggio si sono moltiplicati i segnali premonitori di qualcosa di catastrofico che incombe sulla regione e lo stesso presagio anima la predicazione di un fanatico religioso, Frate Tomas Nunez, che incita gli abitanti alla rivolta contro l'empio Governatore. Due confratelli di Tomas denunciano al loro superiore il fanatismo del predicatore, il quale, ordina contro di loro una spedizione punitiva messa in atto dai suoi esaltati seguaci. Zagor e un giovane ufficiale dell'esercito, il capitano Pastor, riescono a sottrarre uno dei frati dal linciaggio, portandolo nella locanda dove alloggiano. Ma mentre i fanatici fanno irruzione per completare l'opera, la terra comincia a tremare...
Un terremoto di inaudita potenza scuote la città cilena di Concepcion fin dalle fondamenta. Di lì a poco, il mare si ritira per dare origine a un'onda gigantesca che si abbatte sulle rovine, spazzando le strade e uccidendo molti dei superstiti. Zagor e Cico, scampati per miracolo, cercano di aiutare la popolazione. Non passano che poche ore, e una nave battente bandiera britannica getta l'ancora nel porto invaso dai relitti: è il Beagle, un brigantino su cui viaggia un naturalista inglese, Charles Darwin. L'uomo di scienza vuole raccogliere notizie e testimonianze sul cataclisma e si incontra con il Governatore che compie un sopralluogo per valutare il disastro. Entrambi vengono presi di mira dai fanatici di Frate Tomas e lo Spirito con la Scure è costretto a intervenire per salvare loro la vita. Ma è la sua a trovarsi in pericolo...
Proseguendo il loro lungo viaggio, Zagor e Cico giungono a Punta Arenas, l'ultimo porto del Sud America, sullo Stretto di Magellano. Lì, lo Spirito con la Scure riesce per pochi istanti a incrociare la sua pista con quella del traditore Dexter Green, l'archeologo sulle cui tracce si è spinto fino agli estremi confini meridionali del mondo. Ma quando sembra che la caccia stia per concludersi, qualcosa di imprevisto giunge a separare di nuovo i due avversari: dal penitenziario in costruzione nei pressi dell'abitato, un gruppo di pericolosi criminali riesce fuggire e si impossessa della "Marilensa", la nave con cui il Re di Darkwood è giunto fin laggiù...
Nella Terra del Fuoco, Zagor e i suoi amici marinai del veliero "Marilena" stanno cercando di liberare Hilario, catturato dagli Ona, gli indigeni da tutti ritenuti selvaggi e cannibali. Si imbattono in Jemmy Button, un nativo che, alcuni anni prima, aveva navigato a bordo del "Beagle" del capitano Fitzroy. È proprio Jemmy a guidare lo Spirito con la Scure fino al villaggio degli Ona, dove, in una cavità del terreno, vengono tenuti rinchiusi anche i superstiti del gruppo di evasi fuggiti dal carcere di Punta Arenas. Ma riuscire a portare in salvo i prigionieri non sarà un'impresa facile...