Anno 200X. Un disco volante precipita al largo della baia di Tokyo. Al suo interno vengono ritrovati più di centocinquanta alieni: nessuno di loro è in grado di riparare il guasto dell'astronave. Sono costretti a rimanere per sempre sul nostro pianeta.
Giovani, bellissimi, intelligenti, amichevoli, gli alieni, ribattezzati DearS, vengono accolti con benevolenza e curiosità dalla popolazione terrestre e dal paese che li ospita, il Giappone. Tra i pochi a non pensarla così c'è Ikuhara Takeya, ragazzo di diciassette anni: scontroso e svogliato, Takeya vede i DearS come extraterrestri infidi e pericolosi.
Questo finché un giorno non trova per strada una misteriosa ragazza, senza casa e incapace di parlare… un incontro che cambierà la vita di Takeya...
Ren è stata accolta nella scuola superiore di Takeya e tutti sono convinti fosse lei la DearS che era attesa. Compare però un'altra DearS, di nome Miu, che sostiene e dimostra di essere lei, in realtà, la DearS ufficialmente attesa. Si stabilisce di fare una gara per decidere chi avrà diritto di rimanere: corsa, materie scolastiche, e cucina. Nonostante un risultato alla pari, Miu vorrebbe andarsene, ma alla fine si decide che entrambe le DearS rimarranno a scuola.
Nei giorni successivi Miu, mossa da un forte sentimento di rivalità nei confronti di Ren, si accorge che quest'ultima sa pochissimo della Terra e dei terrestri e non è per niente abile in un sacco di cose. Miu, invece, è una DearS esemplare: gentile con tutti, sa cucinare benissimo, sa fare benissimo le pulizie e così via.
Un giorno, inaspettatamente, compare nella casa di Takeya un nuovo DearS, un giovane ragazzo di nome Khi, con cui Miu già era in contatto. Khi informa Takeya di essere stato inviato dalla comunità dei DearS per "ritirare" Ren: in realtà Ren è una schiava difettosa, destinata all'ibernazione perpetua, e sfuggita per sbaglio dalle mani dei DearS. Takeya rimane sconvolto dal fatto che Khi parli di Ren come se fosse un oggetto, senza minimamente considerare i suoi sentimenti. Al che Khi spiega che i DearS sono tutti schiavi creati per servire i loro padroni, privi di sentimenti, di volontà e della capacità di pensare. Improvvisamente, poi, compare un altro misterioso Dears, un omone estremamente aggressivo che vuole ritirare Ren con la forza. Alla fine di un rocambolesco inseguimento, Takeya apprende che Ren, dopo il ritiro, potrebbe anche venire eliminata in quanto "difettosa". Alla fine di un lungo tormento interiore, Takeya proclama che Ren è la sua schiava, e che quindi non possono portagliela via.
In questo numero faremo la conoscenza di Nia, allieva di Xaki. La dedizione e l'ammirazione di Nia per il suo maestro sono tali che è disposta a fare qualunque cosa per lui… compreso il pedinare un numero zero chiamato Ren! Appena viene conoscenza che Ren è sfuggita proprio a Xaki mentre questo tentava di riportarla nella comunità dei DearS, Nia decide di scendere in campo per vendicare il disonore del suo maestro. Nel frattempo, Ren deve vedersela con Hiro, il playboy della classe, che tenta di circuirla insinuandole dei dubbi riguardo al suo rapporto con Takeya. Ma attenzione: è tempo che un nuovo, impetuoso personaggio entri in scena: si tratta di Rubi, una DearS… dominatrice!!
Non si ferma il via vai dei DearS nella vita di Takeya! Dopo aver salvato Khi da un terribile episodio di bullismo, il protagonista vede le proprie già turbolente giornate ulteriormente sconvolte da due nuovi alieni. O meglio: due nuove aliene. Piccole aliene. Innanzi tutto la giovane China, anche lei, come Ren, una Numero Zero, una schiava difettosa in cerca di un padrone con cui sfogare la sua voglia d'affetto e capricci. E poi, una DearS minuscola, innocente e carinissima, priva di nome e parola, ma dotata anche di grandi ed enigmatici poteri, legati in qualche modo a Ren: forse la chiave per scoprire tutti i segreti degli extraterrestri che hanno fatto innamorare il Giappone.
La permanenza sul pianeta Terra sta via via mettendo in crisi tutte le convinzioni dei DearS, gli alieni che si considerano solo degli schiavi in cerca di un padrone da servire. È così che Miu vacilla sempre più nei confronti di Takeya, per il quale, ormai, sembra nutrire un vero e proprio amore. Nel frattempo anche Ren è presa d'assedio, perché Hiro, il playboy della scuola, sembra davvero deciso a fare sul serio con lei…
E mentre Neneko ha i suoi piccoli momenti di gloria grazie a un'esposizione sulle bambole, Io, la nuova piccolissima e tenera aliena piombata inaspettatamente trai nostri personaggi, comincia ad agire in vista di qualche misterioso obiettivo… quale sarà il vero senso della presenza dei DearS sul nostro mondo?
Si apre il sipario sull'ultimo atto di DearS, e gli eventi precipitano sin dall'inizio!
La piccola Io si è chiusa in un bozzolo, che presto si schiuderà per dar luce a una nuova, incredibile creatura. Nel frattempo esce finalmente allo scoperto il padre di Takeya, mostrando di muovere con le sue mani molti fili delle vicende, e mettendo nuovamente in crisi il rapporto tra il figlio e Ren.
È giunto cosí il momento di sapere qual è davvero il senso dell'esistenza dei DearS e la loro importanza per il futuro dell'umanità. È giunto il momento che due ragazzi, un'aliena e un terrestre, decidano tra l'amore o il dolore, tra la vita o la morte… tra l'essere e il non essere, per il bene loro e di tutto il pianeta Terra.